Создание кафедры напрямую связано с бурным ростом судостроительной промышленности в 1930-х годах. Кафедра успешно ответила на потребность страны в инженерах-экономистах для отрасли и ее инфраструктуры.
На кафедре экономики судостроительной промышленности в разное время трудились такие выдающиеся личности, как д.э.н., профессор Логинов С.П., член-корреспондент КазССР, д.э.н., профессор Петухов Р.М. и другие известные ученые, выполнявшие НИОКР, посвященные актуальным проблемам экономики судостроения.
С 2003 по 2020 год кафедру возглавлял почетный работник высшего образования РФ, доктор экономических наук, профессор А.В. Абрамов.
В настоящее время кафедру возглавляет д.э.н., профессор Конягина Мария Николаевна.
Кафедра ежегодно выпускает несколько десятков бакалавров по программе «Экономика и предпринимательство» и магистров экономики по программе «Экономика инноваций и финансовый консалтинг».