Научные специальности, по которым осуществляется обучение в докторантуре СПбГМТУ и подготовка диссертаций на соискание ученой степени доктора наук:

• 2.5.17 – Теория корабля и строительная механика
• 2.5.18 – Проектирование и конструкция судов
• 2.5.6 – Технология машиностроения
• 2.5.8 – Сварка, родственные процессы и технологии
• 2.5.19 – Технология судостроения, судоремонта и организация судостроительного производства
• 2.5.20 – Судовые энергетические установки и их элементы (главные и вспомогательные)
• 2.4.2 – Электротехнические комплексы и системы
• 5.2.3 - Региональная и отраслевая экономика
• 5.7.6 – Философия науки и техники (философские науки)
• 5.6.6 – История науки и техники (исторические науки и технические науки)
• 2.2.11 – Информационно-измерительные и управляющие системы